大坝安全监测系统鉴定中，数据采集装置评价内容包括功能、平均无故障时间、数据采集缺失率、测量准确度。其中重点关注主要功能，主要功能是数据采集装置运行过程中经常使用和保证数据采集装置长期稳定运行的功能，如巡测、选测、定时测量、通信、数据存储、掉电保护、防雷、抗干扰等主要功能。而系统自检、自诊断、人工测量接口、防腐蚀等属次要功能。因此，正确选项为D。