本题中，起重设备为动产，动产物权变动以“交付”为生效要件。双方约定的“交付方式”为占有改定。买卖双方特别约定，合同生效后标的物仍然由出卖人继续占有，但其所有权已完成法律上的转移。因此，通过“占有改定”的交付方式，合同双方已完成标的物所有权在法律上的转移。
因此，设备公司是该设备的所有权人，B正确，A错误。
且C错误E正确，不是简易交付而是占有改定。
“简易交付”是指，标的物在订立合同之前已为买受人占有，合同生效即视为完成交付。占有改定的条件是双方的“约定”，而非交付相应票据，所以“交付设备增值税转专用发票”只能证明合同双方存在标的物价款的给付，是债权行为，而非“占有改定”的物权“交付”行为。因此，D选项错误。
【考点来源】2Z204032买卖合同的法律规定