监测自动化系统的防雷措施包括：(1)电源防雷采用多级泄放回路，如三相/单相电源避雷器等，隔离电源入雷通道（A正确）；(2)二次反击技术处理中，优化接地系统结构，将防雷装置、建筑地网等全部电气连接，构成等电位环形接地网，避免二次反击（B正确）；(3)室外电源、信号电缆利用电磁屏蔽技术防雷，保护管一般采用镀锌钢管且接头焊接（C正确）。对于无线通信系统，无线发送的信号馈线应选择合理路径，避免沿山顶山脊走线，避开高大孤树及独立避雷针引下网，故D选项错误。