解析：正确答案为AE；详见2019年教材304页：分包项目的施工措施计划、开工申报、工程质量检验、工程变更以及合同支付等，通过承包人向监理机构申报，所以A选项正确；除非发包人授权或工程施工合同文件另有规定，否则监理机构不受理承包人与分包人之间的分包合同纠纷，所以B选项错误；工程变更指令由发包人或发包人授权监理机构审查、批准后发出，所以D选项错误；教材189页：监理人是受发包人委托在施工现场实施合同管理的执行者。监理人按发包人与承包人签订的施工合同进行监理，监理人不是合同的第三方。所以C答案错误，监理与设计单位并无直接关系，只是属于建设项目的各自参与者；监理人发出的任何指示应视为已得到发包人的批准，但监理人无权免除或变更合同约定的发包人和承包人的权利、义务和责任，因此E答案正确。