特别重大生产安全事故由国务院或者国务院授权有关部门组织事故调查组进行调查，选项A正确；
重大事故、较大事故、一般事故分别由事故发生地省级人民政府、设区的市级人民政府、县级人民政府负责调查。选项B错误；
未造成人员伤亡的一般事故，县级人民政府也可以委托事故发生单位组织事故调查组进行调查。C正确；
特别重大事故以下等级事故，事故发生地与事故发生单位不在同一个县级以上行政区域的，由事故发生地人民政府负责调查，事故发生单位所在地人民政府应当派人参加。选项D错误；
事故调查组应当自事故发生之日起60日内提交事故调查报告。选项E错误。