A项，《水利水电工程标准文件》通用合同条款规定，质量保证金的计算额度不包括预付款的支付与扣回金额。BC两项，质量保证金一般分两次退还。合同工程完工证书颁发后14天内，发包人将质量保证金总额的一半支付给承包人。在合同约定的缺陷责任期满时，发包人将在30个工作日内会同承包人按照合同约定的内容核实承包人是否完成保修责任。如无异议，发包人应当在核实后将剩余的质量保证金支付给承包人。在合同约定的缺陷责任期满时。D项，承包人没有完成缺陷责任的，发包人有权扣留与未履行责任剩余工作所需金额相应的质量保证金余额，并有权根据合同约定要求延长缺陷责任期（工程质量保修期），直至完成剩余工作为止。E项，监理人在颁发了缺陷责任证书后，若仍发现有工程缺陷，应由承包人维修，剩余的保留金仍可暂不退还。