多式联运合同与单式运输有以下区别：承运人承担责任的制度不一样。在多式联运中，不管多式联运经营人与其他承运人如何约定，都由多式联运经营人对全程运输负责任；在单式联运中，首要原则是由与托运人订立合同的承运人对全程运输承担责任，但如果明确知道损失发生在某一运输区段的，则由该区段的承运人与订立合同的承运人承担连带责任。