1.该质量事故的处理程序如下：
（1）报建设单位同意后，及时下达工程暂停令；
（2）审查事故处理技术方案；
（3）跟踪监督桩基础工程处理过程；
（4）验收桩基础工程处理结果；
（5）经建设单位同意后签发工程复工令；
（6）将完整的质量事故处理记录整理归档。
2.正确答案：根据《标准施工合同示范文本》因不可抗力造成损失，不可抗力造成的损失由发包人和承包人分别承担：
（1）永久工程，包括已运至施工场地的材料和工程设备的损害，以及因工程损害造成的第三方人员伤亡和财产损失由发包人承担；
（2）承包人设备的损坏由承包人承担；
（3）发包人和承包人各自承担其人员伤亡和其他财产损失及其相关费用；
（4）停工损失由承包人承担，但停工期间应监理人要求照管工程和清理、修复工程的金额由发包人承担；
（5）不能按期竣工的，应合理延长工期，承包人不需支付逾期竣工违约金。发包人要求赶工的，承包人应采取赶工措施，赶工费用由发包人承担。
项目监理机构对施工单位的索赔申请应处理如下：
（1）在建工程损失8万元，同意该部分索赔；施工机具损坏损失3万元，不同意该部分索赔；
（2）施工单位受伤人员医药费、补偿金1万元，不同意该部分索赔；
（3）施工机械闲置、施工人员窝工损失2万元，不同意该部分索赔；
（4）工程清理、修复费用1万元，同意该部分索赔；
（5）工期补偿7天，同意该部分索赔。
3.（1）分包单位向监理机构提交了《分包单位资格报审表》及相关资料不妥，按照总分包的合同管理关系，分包单位的资格报审表及相关资料应通过施工单位报送。
（2）专业监理工程师审查认可后，同意分包单位进场施工不妥。专业监理工程师对分包单位的资格材料进行完整的审查后，还应提交由总监理工程师认可，由总监理工程师签发同意分包单位进场的通知。
4.建设单位要求将工程档案提交项目监理机构，由项目监理机构组织工程档案验收不妥。
理由：工程档案应提交建设单位，由建设单位对工程档案进行验收。